磁珠法分离细胞是基于细胞表面抗原能够与磁珠表面连接的特异性抗体相结合，在外加磁场中进行分离，该方法高效简捷，一般分为阳性分选与阴性分选。
MagneStar® MP5-Tosyl和-Streptavidin 磁珠具有与淋巴细胞相近的粒径（5.5 μm），适合用于磁性细胞分选。
当用作阳性分选时，由于磁珠会不可逆地结合在细胞表面，因此分离得到的细胞只适合用于分子生物学类实验（因细胞后续会被裂解）。如果分选的细胞需要用于培养或者流式分析，则最好使用阴性分选。此外，当细胞数量较多时也可选用粒径较小的MP3磁珠因其具有更大的比表面积与结合容量。
此外，已经实验证明可以同时偶联anti-CD3与anti-CD28两种抗体，用于T细胞激活实验。
